Junior catan loopt op een ring van zes eilanden waarin spelers schuilplaatsen bouwen en het mysterieuze verrukte eiland vinden, waar de spookkapitein woont.Elk eiland genereert een specifieke grondstof:Hout, geiten, melasse of zwaarden.Spelers moeten deze middelen gebruiken om boten te bouwen, hun domeinen uit te breiden en nieuwe schuilplaatsen te bouwen om het bord te domineren.